Ornidazolün kullanımı metronidazole benzer. Her ikisi de 5-nitroimidazol türevi olup protozoal enfeksiyonlarda ve anaerobik enfeksiyonlarda etkin olarak kullanılırlar.
· Trichomoniasis, Trichomonas vaginalis’ e bağlı genito üriner enfeksiyonlarda;
· Amebiasis, amipli dizanteri dahil Entamoeba histolytica’ nın neden olduğu tüm intestinal enfeksiyonlarda, amebiasis’ in tüm ekstraintestinal formlarında özellikle karaciğerde oluşan ameboik abselerde;
· Giardiasis’ de;
· Anaerob bakterilere bağlı enfeksiyonlarda, septisemi, menenjit, peritonit, postoperatif yara enfeksiyonları, doğum sonrası septisemi, septik abortun ve sözü edilen bakterilerin tespit edildiği (varlığından şüphelenildiği) her durumda kullanılır.
Bu durumların hepsinde tedavi edici amaçla kullanılmasının yanı sıra kolon ve jinekolojik ameliyatlardan önce veya başka cerrahi müdahalelerde profilaksi amacıyla da kullanılabilir.