1-Siprofloksazin başlıca böbreklerle itrah edildiğinden böbrek fonksiyonları ileri derecede bozuk veya dializdeki hastalarda dozaj 1/3-1/2 oranında azaltılmalıdır. Mümkünse serum konsantrasyon eğrisi tayin edilmemelidir.
2-Siprofloksazin hastaların reaksiyon kapasitesini değiştirebilir. ve alkol buetkiyi arttırır. Otomobil ve makina kullananlar, yüksekte çalışanlar bu konuda uyarılmalıdır.
3-Siprofloksazin tedavisi sırasında süperenfeksiyonlar görülebilir. Özellikle enterokolit vakalarında dışkı kültürü ve hassasiyet testi yapılmalıdır. Antidiareik kullanılmamalıdır.4-Antasidler Siprofloksazin'in biyoyararlığını azaltır, ancak absorpsiyon hızını değiştiremez.Siprofloksazin ileantasidler'in alımı arasında en az 2 saat ara olmalıdır. Teofilinin etkisini güçlendirebilir.
5-S.S.S. Lezyonları mevcut olan hastalarad özellikle konvülsiyon geçirenlerde ihtiyatla kullanılmalıdır.
6-Kristaluri riski nedeniyle aşırı alkali idrardan kaçınmalı, yeterli miktarda sıvı alınımına dikkat edilmelidir.
7-Bütün antibiyotiklerde olduğu gibi Siprofloksazin ile de psödomembranöz enterokolit görülebilir. Bu vakaların çoğu ilacın kesilmesiyle iyileşirse de ağır vakalarda intravenöz su ve elektrolitler ve oral vankomisin tedavisi gerekebilir.
8-Gebelerde, emzirenlerde, gelişme fazını tamamlamamış bulunan çocuk ve gençlerde kullanılmamalıdlr.
9-Siprofloksazin kas kuvvetinde azalmaya yol açarak yorgunluk, kuvvetsizlik, bitkinlik gibi yan etkiler yapabilir ve myasthenia gravisli hastalarda miyastenik krizlere neden olabilir. Bu hastalarda bu olasılığa karşı önlem alınmalıdır.