Diğer antibakteriyel preparatlarda olduğu gibi, uzun süreli kullanım mantarlar dahil duyarlı olmayan mikroorganizmaların aşırı çoğalması ile sonuçlanabilir. Belirgin sistemik absorpsiyonu takiben, neomisin gibi aminoglikozidler irreversibl ototoksisiteye neden olabilirler. Oküler kullanım sonrasında böyle bir etkinin bildirilmemiş olmasına rağmen, yüksek dozlarda veya uzun süreli tedavi sonrası bu olasılık değerlendirilmelidir. Mutajenisite/Karsinojenisite/Fertilite: Etken maddelerin mutajenik, karsinojenik veya fertiliteyi etkileyen özelliklerinin olup olmadığını belirlemek için bilgi yetersizdir. Teratojenisite: Etken maddelerin teratojenik özelliklerinin olup olmadığını belirlemek için bilgi yetersizdir. Anne kanında bulunan neomisin, plasentayı geçebildiğinden, teorik olarak fötal ototoksisite riski söz konusu olabilir. Gebelik ve emzirme döneminde kullanımı: Neosporin göz damlasının insan veya hayvan gebelik döneminde etkilerine ilişkin bilgi mevcut değildir. Tedavinin klinik yararı gelişmekte olan fetusa bilinmeyen muhtemel risklerle dengelenmelidir. Etken maddelerin insan sütünde atımı ile ilgili bilgi yoktur.
