İlaca karşı aşırı duyarlılığı bilinen hastalarda, alkolizmli psoryazis hastalarında, alkolik karaciğer hastalığı veya diğer kronik karaciğer hastalığı olan hastalarda, açık bir şekilde bağışıklık yetersizliği sendromu olan veya laboratuar tanısı olan psoryazislı hastalarda, kemik iliği hipoplazisi, lökopeni, trombositopeni veya belirgin anemi gibi daha önce diskrazisi olan psoryazisli hastalarda kontrendikedir.
Gebelik
Methotrexate fetal ölümlere ve konjenital anormalliklere sebep olmuştur. Methotrexate psoryazisli hamile hastalara kontrendikedir ve sadece potansiyel faydanın fetüs üzerindeki riskten daha ağır bastığı durumundaki neoplastik hastaların tedavisinde kullanılmalıdır.
Emzirme
Emzirilen bebeklerde methorexate'dan dolayı oluşabilecek ciddi advers reaksiyonlardan dolayı emzirme olmamalıdır.