Rifampisin tedavisi sırasında aşağıdaki yan etkilerin görülebileceği belirtilmiştir.
Gastrointestinal :Epigastrik yanma, iştahsızlık, bulantı, kusma, kramplar, diyare nadiren hepatit.
Hematolojik : Nadiren trombositopeni (tedavinin kesilmesiyle düzelir), geçici lökopeni, hemolitik anemi.
S.S.S : Baş ağrısı, ateş, halsizlik, ataksi, konsantrasyon bozukluğu, mental konfüzyon, kas zayıflığı, nadiren myopati.
Göz : Görme bozukluğu.
Endokrin : Mensturasyon bozukluğu.
Renal : Üre ve ürik asit yükselmesi nadiren hemoglobinüri, hematüri, interstisiyel nefrit, renal yetmezlik.
Dermatolojik : Flaşing, kaşıntı.
Hipersensivite Reaksiyonları : Kaşıntı, ürtiker, kızarıklık, eozinofili.
Diğer : Yüz ve ekstremitelerde ödem. Flu sendromu (ateş, titreme, baş ağrısı, sersemlik ve kemik ağrısı), hipotansiyon.
Laboratuvar testleri : Karaciğer enzimlerinde (SGOT, SGPT) yükselme, bilirubinemi.
