Metisiline -dirençli stafilokokların duyarlı suşların neden olduğu ciddi veya şiddetli enfeksiyonların tedavisinde endikedir. Penisiline alerjisi olanlarda veya sefalosporinler dahil diğer ilaçlara dirençli olup vankomisin-duyarlı organizmaların sebep olduğu enfeksiyonlarda endikedir. Metisiline-dirençli stafilokoktan şüphelenildiğinde Vankomisin Hidroklorür başlangıç tedavisi olarak endikedir,ama duyarlılık bilgileri elde edildikten sonra, tedavi gerektiği şekilde ayarlanmalıdır.
Hidroklorür stafilokokal endokarditin tedavisinde etkilidir. Etkinliği stafilokokların neden olduğu diğer enfeksiyonlarda da bildirilmiştir. Stafilokok enfeksiyonları lokalize ve cerahatli olduğu zaman, antibiotikler uygun cerrahi tedavilere ek olarak kullanılır.
Vankomisin Hidroklorür'ün yalnız veya aminoglikozitle kombinasıyon halinde, viridans veya S. bovis'in n eden olduğu endokardite etkili olduğu prostetik valf endokardit tedavisinde etkili olduğu bildirilmiştir.
Vankomisin Hidroklorür rifampin veya aminoglikozidle birlikte veya her ikisiyle birlikte S. epidermis veya difteroidlerin neden olduğu prostetik valf endokarditinin erken başlangıcında başarıyla kullanılmıştır.
Enfeksiyona neden olan organizmaları izole etmek ve tanımlamak ve Vankomisin Hidroklorür'e duyarlıklarını saptamak için , bakteriyolojik kültür numuneleri sağlanmalıdır.
Vankomisin Hidroklorür'ün parenteral şekli, C. difficile'nin oluşturduğu antibiotikle alkalı psödomembranöz kolitin tedavisinde oral olarak uygulanbilir. Vankomisin Hidroklorür'ün bu endikasyonda tek başına parenteral olarak kullanımı, bu endikasyon için ispatlanmamış bir yararıdır. Vankomisin Hidroklorür, diğer enfeksiyon türlerinde oral yolla etkili değildir.
Her ne kadar, kontrollü klinik etkinlik çalışmaları yapılmamışsa da , intravenöz Vankomisin hidroklorür penisiline allerjisi olan , konjenital kalp hastalığı , romatizmal veya diğer edinilmiş valvüler rahatsızlığı olan ve üst solunum yolu ve dişle ilgili ameliyat olacak hastalarda bakteriyel endokardite karşı proflaktik olarak kullanılmıştır.
